مصرف سی ال ای می‌تواند باعث کاهش وزن و چربی سوزی از طریق واکنش‌های بیوشیمیایی شود که این خود در نهایت باعث افزایش میزان متابولیسم پایه می‌شود. افزایش میزان متابولیسم پایه بدین معناست که باید کالری بیشتری برای انجام یک فعالیت سوزانده شود. متابولیسم پایه حداقل مقدار انرژی است که بدن نیاز دارد تا فعالیتی را انجام دهد. CLA در تغییر یک سری واکنش‌های متابولیکی که فعالیت سلول‌های چربی بدن را تنظیم می‌کنند، دخیل است. تصور می‌شود که از طریق افزایش سی آل ای، BMR می‌تواند میزان درصد چربی به عضله را کاهش داده و مصرف انرژی را افزایش دهد. اثر سی ال ای بر کاهش چربی بدن در نتیجه مکانیسم های متعددی است از جمله افزایش مصرف انرژی از طریق کاهش تجمع چربی در بافت های چربی، افزایش اکسیداسیون چربی، کاهش میزان دریافت انرژی و ممانعت از فعالیت آنزیم‌های مؤثر در متابولیسم اسیدهای چرب و آنزیم‌های لیپوژن که از مهم‌ترین مکانیسم‌های عمل CLA برای کاهش توده چربی هستند.